根據(jù)日本《海關(guān)法》規(guī)定，一般情況下，應(yīng)將進(jìn)出口貨物運(yùn)入保稅區(qū)域后，再向海關(guān)申報(bào)。海關(guān)接到進(jìn)口申報(bào)后，進(jìn)行單證審查和必要的貨物查驗(yàn)，有稅貨物原則上待企業(yè)繳納關(guān)稅等稅金后,海關(guān)予以放行,收貨人方能提貨。

日本進(jìn)口通關(guān)時(shí)需提供的單證如下：
    1．發(fā)票
    2．提單、運(yùn)單。海運(yùn)：（Bill of LADING:B/L 或 Sea Way Bill：SWB），空運(yùn)：（Air Way Bill:AWB）
    3．保險(xiǎn)費(fèi)清單
    4．運(yùn)費(fèi)明細(xì)單
    5．包裝說(shuō)明書(shū)
    6．委托報(bào)關(guān)、報(bào)檢的須提交代理委托書(shū)。

此外，有的貨物需要以下單證：

    1．動(dòng)植物檢疫證（動(dòng)、植物檢疫所出具）
    2．原產(chǎn)地證明（需享受特惠關(guān)稅時(shí)，由日本工商會(huì)議所頒發(fā)）
    3．減免稅證明（如加工、修理物品在出口的免稅，由海關(guān)出具）
    4．衛(wèi)生證明書(shū)（由出口國(guó)官方食品檢查機(jī)關(guān)出具）
    所有單證目前均通過(guò)電子數(shù)據(jù)方式向海關(guān)提供，海關(guān)對(duì)通關(guān)電子單證審核后，認(rèn)為無(wú)需核查紙質(zhì)單證時(shí)進(jìn)行電子單證放行。但還需查證原件或核實(shí)數(shù)量等情況時(shí)，企業(yè)應(yīng)在電子單證放行后3日內(nèi)向海關(guān)提交或出示單證原件。